Technologieplattform für Spatial Transcriptomics - Atera System

Beschaffung eines Systems zur Transkriptomanalyse und RNA-Sequenzierung auf Einzelzellebene.

Für den Einsatz in Forschungsprojekten wird ein System benötigt, welches die Darstellung des gesamten Transkriptoms ermöglicht sowie einen hohen Durchsatz an Proben und die Untersuchung einer möglichst großen Gewebefläche von bis zu 4x 5 cm2 pro Messlauf erlaubt.

Der Auftrag kann nur von einem bestimmten Wirtschaftsteilnehmer ausgeführt werden, da aus technischen Gründen kein Wettbewerb vorhanden ist. Das System der Atera Plattform ermöglicht eine bildgebende In-situ-Technologie mit Rolling Circle Amplification (RCA), die eine hochsensitive und spezifische Erfassung von RNA-Transkripten bei gleichzeitiger Erhaltung der Gewebemorphologie zulässt. Ebenso wird durch die Atera Plattform eine räumliche RNA-Detektion mit einer Auflösung von <30 nm (XY) und <150 nm (Z) und der Analyse großer Gewebeflächen (>5 cm² pro Objektträger) im hohen Probendurchsatz (bis zu 800 1-cm² Proben pro Jahr) ermöglicht. Durch diese Technologie erlaubt Atera eine Auflösung von bis zu 18.000 Gen-Targets. Eine Kapazitätserweiterung um bis zu 1.000 zusätzlichen individuelle Transkripten wird für bestimmte Forschungsfragestellungen benötigt. Vergleichbare Geräte anderer Hersteller erzielen nicht den geforderten Probendurchsatz und die benötigte Vielfalt an detektierbaren Transkripten. Vor diesem Hintergrund kommt für Forschungszwecke in der Transkriptomanalyse nur die Technologieplattform Atera der Firma 10x Genomics in Frage.